Al momento non si conoscono le cause esatte, ma alcune di queste sono:
- Storia familiare: il 30% delle donne con menopausa prematura hanno precedenti in famiglia.
- Malattie autoimmuni: i propri anticorpi possono danneggiare le ovaie.
- Anomalie cromosomiche.
- La chirurgia, la radio e la chemioterapia alle ovaie.
La menopausa precoce può portare ad una serie di problemi, oltre a quelli già noti, come ad esempio la sterilità nelle donne in età fertile.